上世纪90年代，新会港天马作业区正式开始建设，投产的新会港一期码头为5000t级泊位两个，500t级泊位一个，码头岸线总长度260米。码头设计年吞吐量86万吨。
随着新会地方经济发展，新会港一期码头泊位已不能适应地方经济发展需求，2002年始，原新会港务有限责任公司就展开了新会港二期工程建设前期工作。2003年新会港转制后，由我集团下属广东新会港国际货运码头有限公司司继续进行新会港二期建设。2004年-2005年完成工程前期立项报批工作；2005年开始进行码头后方陆域回填；2006年-2007年完成码头主体设计及招投标工作；2007年8月底码头主体正式开工建设，至2014年9月码头主体建成并交工验收。
目前新会港二期码头建设规模已经扩展为10000t级多用途泊位两个（码头结构30000t级泊位设计施工）。其中码头标准段长度355m，码头结构型式为典型高桩梁板式结构。码头前沿停泊水域底,目前按1万吨级疏浚至-10.1米，计划后期按3万吨级船型疏浚至-14.1米。本工程设计年吞吐量为91万吨，其中集装箱为9万TEU，散杂货为10万t。
在装卸工艺方面，2014年，二期码头已配置3台全新的多用途轨道式门座起重机，其中1台最大吊重量为50吨，最大外伸距36米；2台最大吊重量40吨，最大外伸距36米。3台设备已安装完成。2015年，计划在后方集装箱堆场将建设3条45米跨度的轨道，近期规划投入双悬臂电动轨道式龙门起重机（RMG）2台，远期规划投入6台，该机最大起重量45吨，轨距45米，将成为集装箱堆场的主力吊装机械设备。其他机械设备还配备有可以堆叠7层高的空箱堆高机2台，港内集装箱拖车10台，3吨-25吨的叉车20台。
在通信控制及计算机管理方面，新建通关闸口计划采用无线射频识别（RFID）自动系统，为港区无纸化报关及一票通的发展做好相应的基础；闸口设计为三进两出，一条超宽车道，一共五条车道；车道上，安装有汽车衡稳重设备（地磅），用于车辆货物的重量数据收集；全港区设置闭路电视监控系统，并在新建办公楼设置中控调度中心，实现疏浚与海关、边防等监控实现无缝对接共享；。
港区配套建设的名冠物流园总规划为11栋物流仓储仓库及1栋6层的办公楼，总建筑面积约为167976m2，一期建设工程的4座仓储仓库将于2015年3月底建成，投产后将实现水路与陆路交通运输方式相连结、相转换，集综合运输，货物仓储，货运配载，装卸搬运，信息处理，检查检疫，商务咨询，招商引资等功能于一身，实现多品种、多批量、多用户的室内配送的优势。将会为本地进出口企业提供稳定可靠、优质高效的港口物流服务。
根据二期码头及后方陆域工程建设进度，新会港二期将于2015年下半年投产使用。到时，新会港投产必将进一步带动江门区域的物流运输业的腾飞发展并辐射带动华南和珠江三角洲经济的发展，成为华南区域、特别是江门区域支线箱源和国际中转箱源的集散地。新会港再度开辟沿海集装箱航线和近洋国际班轮航线，形成江海联运能力，将成为西江流域江海联运的枢纽，为地方经济持续发展做出贡献。
万众瞩目，国家级一类港口的新会港，蓄势待发、将展翅高飞。
